Tandis que les danseurs répètent leur prochain ballet, Charles, le petit fantôme de l’Opéra, déambule dans le décor somptueux du Palais Garnier.
Un matin, il rencontre Clara, une jeune danseuse, dans la salle des costumes. Ensemble, ils partent à la découverte des trésors cachés de l’Opéra : les loges feutrées, les coulisses mystérieuses, le lac souterrain et, bien sûr, la majestueuse salle de spectacle.
